如果胚胎在医院冷冻了两年，期间没有继续缴费，医院通常会根据相关规定和流程来处理这种情况。不同医院的政策可能略有不同，但大致流程是这样的：

首先，医院在你冷冻胚胎的时候，通常会和你签订一份协议，里面会写清楚保存期限、缴费时间、逾期处理办法等。如果你在冷冻期间没有按时缴费，医院会先尝试联系你，提醒你及时补缴费用。这种联系可能是通过电话、短信，或者书面通知的方式进行。

如果多次联系你都没有回应，或者你明确表示不再继续保存这些胚胎，医院就会按照协议里的规定来处理。处理方式可能包括：

1. 停止保存并销毁胚胎：这是最常见的做法。医院会根据协议，在一定时间后停止冷冻保存，并对胚胎进行合法、合规的销毁处理。这个过程是严格按照医学伦理和法律法规来进行的，不会随便丢弃或另作他用。

2. 延长宽限期：有些医院可能会给一个宽限期，比如再给你几个月时间来缴费。如果在这个期限内你还是没有缴费，那就会进入销毁流程。

3. 保留一段时间后销毁：有的医院可能会规定，即使你没有缴费，也会保留一段时间，比如再保留半年或一年，之后如果没有缴费，就统一销毁。

需要说明的是，胚胎冷冻是一项需要持续投入成本的技术，医院要维持低温环境、定期检查设备、保障安全运行。如果患者长期不缴费，医院也无法无限期保存。

如果你是担心自己之前冷冻的胚胎现在没有缴费，建议尽快联系当时做手术的医院或生殖中心，问问他们目前的情况。大多数医院都会理解患者可能遇到的困难，也愿意沟通解决办法。如果你确实不再需要这些胚胎，也可以主动联系医院，签署销毁协议，这样心里也能踏实一些。

总之，医院不是一发现没缴费就立刻销毁，一般都会有通知和流程。如果你确实有特殊情况，也可以尝试和医院沟通，看看有没有补救的办法。